22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2913 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  306  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  79.71 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  68.35 
 
 
183 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  69.34 
 
 
142 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  67.86 
 
 
144 aa  175  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  63.7 
 
 
144 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  76.81 
 
 
143 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  54.29 
 
 
142 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  51.8 
 
 
170 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  57.36 
 
 
143 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  50.39 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  48.18 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  53.91 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  42.39 
 
 
121 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  50.79 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
438 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  36.78 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  41.82 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  36.67 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  37.8 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  41.27 
 
 
185 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>