78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1120 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  44.81 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
155 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  39.04 
 
 
179 aa  104  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.91 
 
 
508 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  33.52 
 
 
438 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  40.37 
 
 
197 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  38.46 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.16 
 
 
505 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  34.59 
 
 
209 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  34.78 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  35.52 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  39.84 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  34.55 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  33.89 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  30.63 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  30.88 
 
 
140 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  28.48 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  31.55 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  39.51 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  37.37 
 
 
369 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  30.95 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  44.93 
 
 
143 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  31.67 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  35.19 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  34.55 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  32.14 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2630  hypothetical protein  42.03 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270829  normal  0.371489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  31.9 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  29.56 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  31.43 
 
 
507 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  40.74 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  25.37 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  30.39 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3127  dual specificity protein phosphatase  35.53 
 
 
166 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368556  normal  0.033409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  37.18 
 
 
138 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  35.45 
 
 
161 aa  51.6  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40 
 
 
419 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  27.22 
 
 
162 aa  51.2  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  27.65 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  45.76 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  32.11 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  31.63 
 
 
363 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.48 
 
 
478 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  29.45 
 
 
478 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  28.99 
 
 
152 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  46.43 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.22 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  41.54 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  33.96 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  35.96 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3000  effector protein SptP  31.62 
 
 
535 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00132386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  26.92 
 
 
179 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  41.79 
 
 
346 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  51.11 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  38.98 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  33.98 
 
 
500 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  34.83 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2133  dual specificity protein phosphatase  31 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.215956  normal  0.306582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  35.09 
 
 
163 aa  44.7  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0154  hypothetical protein  35.87 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  40.68 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0309  hypothetical protein  35.87 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  41.98 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  41.82 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3188  effector protein SptP  33.33 
 
 
535 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  32.98 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3083  effector protein SptP  33.33 
 
 
535 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  hitchhiker  0.00000941933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  41.94 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  31.68 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  32.67 
 
 
156 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  31.87 
 
 
547 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3031  effector protein SptP  31.62 
 
 
535 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.493987  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  43.64 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  30.93 
 
 
167 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>