23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5761 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5761  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  283  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.133561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0405  dual specificity protein phosphatase  69.72 
 
 
142 aa  202  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163885  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2695  dual specificity protein phosphatase  66.67 
 
 
183 aa  196  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2913  hypothetical protein  79.71 
 
 
158 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5897  dual specificity protein phosphatase  66.67 
 
 
144 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0844449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3138  dual specificity protein phosphatase  78.01 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2311  dual specificity protein phosphatase  65.69 
 
 
144 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00488678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0322  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 
170 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6060  hypothetical protein  51.47 
 
 
142 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1243  dual specificity protein phosphatase  55.15 
 
 
143 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38720  hypothetical protein  48.82 
 
 
138 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5017  hypothetical protein  46.48 
 
 
169 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0391  dual specificity protein phosphatase  48.57 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4135  dual specificity protein phosphatase  48.57 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000446096  hitchhiker  0.00000714584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2319  hypothetical protein  48.44 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0507937  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  38.33 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  37.78 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40.68 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
438 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04680  protein-tyrosine-phosphatase, putative  32.05 
 
 
1409 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.727329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  43.64 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  32.61 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  40.35 
 
 
155 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>