18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3083 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3188  effector protein SptP  99.63 
 
 		 535 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3000  effector protein SptP  98.5 
 
 		 535 aa  1095    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00132386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3031  effector protein SptP  97 
 
 		 535 aa  1077    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.493987  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3083  effector protein SptP  100 
 
 		 535 aa  1115    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  hitchhiker  0.00000941933 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0067  protein-tyrosine-phosphatase YopH  32.08 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0003  outer membrane virulence protein YopE  32.73 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2271  SicP binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 1347 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1967  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1348 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2064  virulence protein IcsB  26.87 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0764  virulence protein IcsB  26.87 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2153  BopA protein  26.87 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2083  BopA protein  26.87 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00560  exoenzyme T  25.56 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507826  normal  0.0561586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0849  BopA protein  26.87 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0562  BopA protein  26.87 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0311262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1521  BopA protein  26.87 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0414418  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06982  protein tyrosine phosphatase (Pyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04710)  23.53 
 
 		 685 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 189 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>