17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3031 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3188  effector protein SptP  96.63 
 
 
535 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3000  effector protein SptP  96.64 
 
 
535 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00132386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3031  effector protein SptP  100 
 
 
535 aa  1113    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.493987  normal  0.0451218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3083  effector protein SptP  97 
 
 
535 aa  1077    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  hitchhiker  0.00000941933 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0067  protein-tyrosine-phosphatase YopH  32.08 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0003  outer membrane virulence protein YopE  30.91 
 
 
219 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2271  SicP binding domain-containing protein  31.03 
 
 
1347 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.169199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1967  hypothetical protein  31.03 
 
 
1348 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00560  exoenzyme T  24.06 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507826  normal  0.0561586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0849  BopA protein  25.37 
 
 
512 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06982  protein tyrosine phosphatase (Pyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04710)  24.12 
 
 
685 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2064  virulence protein IcsB  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0764  virulence protein IcsB  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2153  BopA protein  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2083  BopA protein  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0562  BopA protein  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0311262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1521  BopA protein  25.37 
 
 
512 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0414418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>