14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0562 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1521  BopA protein  99.02 
 
 		 512 aa  1018    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0414418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0562  BopA protein  100 
 
 		 512 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0311262  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0849  BopA protein  90.23 
 
 		 512 aa  917    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2083  BopA protein  99.02 
 
 		 512 aa  1018    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2153  BopA protein  98.83 
 
 		 512 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2064  virulence protein IcsB  99.02 
 
 		 512 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0764  virulence protein IcsB  99.02 
 
 		 512 aa  1018    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0164  virulence protein IcsB  30.85 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.479195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1967  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1348 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2271  SicP binding domain-containing protein  29.31 
 
 		 1347 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3083  effector protein SptP  26.87 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  hitchhiker  0.00000941933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3000  effector protein SptP  26.87 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00132386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3188  effector protein SptP  26.87 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3031  effector protein SptP  25.37 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.493987  normal  0.0451218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>