60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2331 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  100 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  98.77 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  40.13 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  43.83 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  40.74 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  39.75 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  40.12 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  40.37 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  36.88 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  30 
 
 		 508 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.18 
 
 		 505 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  30.59 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  27.17 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  27.61 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32.16 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.74 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.81 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  27.75 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.48 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.89 
 
 		 438 aa  60.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  26.87 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  28.93 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  41.25 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  27.94 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  26.24 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  29.84 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  27.34 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  27.5 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  24.03 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  26.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.89 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.05 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  30.7 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  27.87 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  31.03 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.79 
 
 		 507 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.12 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  23.85 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34403  predicted protein  28.7 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  30.5 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  25.64 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  27.73 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  29.94 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 		 298 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 		 156 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  44.19 
 
 		 238 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  25.77 
 
 		 565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  25.77 
 
 		 565 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  25.77 
 
 		 565 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  30.85 
 
 		 595 aa  40.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>