49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002127 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  100 
 
 
164 aa  332  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  87.2 
 
 
164 aa  298  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  56.71 
 
 
165 aa  193  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  61.96 
 
 
165 aa  187  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  44.85 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  37.42 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  37.8 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  40.99 
 
 
163 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  40.37 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  36.65 
 
 
166 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  34.62 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.01 
 
 
505 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  31.85 
 
 
209 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  29.49 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.52 
 
 
490 aa  80.9  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.17 
 
 
508 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  29.56 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.15 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  31.21 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  28.98 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
438 aa  57.4  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  29.41 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.6 
 
 
206 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.34 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  28.67 
 
 
500 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.65 
 
 
189 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  33.33 
 
 
562 aa  50.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  27.97 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  26.71 
 
 
147 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  30.4 
 
 
560 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  26.32 
 
 
547 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  30.33 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  23.93 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  24.58 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  26.61 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  27.66 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  27.56 
 
 
568 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  27.56 
 
 
563 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  27.94 
 
 
369 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  28.35 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  27.56 
 
 
563 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  27.56 
 
 
563 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  28.57 
 
 
550 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  38.24 
 
 
188 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  26.32 
 
 
565 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  35.09 
 
 
222 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  27.78 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  26.72 
 
 
121 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>