22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60110 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  100 
 
 
562 aa  1182    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05057  protein-tyrosine phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12250)  47.19 
 
 
595 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000599023  hitchhiker  0.0000000000000767856 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04770  phosphoprotein phosphatase, putative  41.32 
 
 
761 aa  262  8.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52425  predicted protein  38.28 
 
 
298 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  27.66 
 
 
507 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  29 
 
 
147 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  25.74 
 
 
152 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
164 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  28.04 
 
 
161 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.05 
 
 
164 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  28.75 
 
 
169 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.73 
 
 
478 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  30.3 
 
 
165 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  30.67 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.62 
 
 
508 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  32.31 
 
 
165 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  35.48 
 
 
430 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  35.48 
 
 
438 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  26.13 
 
 
490 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  37.68 
 
 
155 aa  44.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  35.48 
 
 
438 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14549  predicted protein  24.59 
 
 
171 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>