More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1595 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  100 
 
 		 507 aa  994    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  38.99 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  32.81 
 
 		 253 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  31.33 
 
 		 169 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 		 253 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 299 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  33.6 
 
 		 265 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  30.36 
 
 		 244 aa  88.2  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  28.11 
 
 		 246 aa  87  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0560  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  27.12 
 
 		 255 aa  87  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  33.8 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1905  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  28.16 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.22 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2485  ABC transporter related  30.99 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf864  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  26.51 
 
 		 273 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  31.6 
 
 		 263 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  31.87 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  31.87 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.2 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  29.88 
 
 		 244 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  34.55 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0550  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0373794  hitchhiker  0.0000103016 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.74 
 
 		 592 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  30.45 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  33.76 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  33.61 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  33.76 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.23 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1061  ABC transporter related  29.06 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0787391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  28.88 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  29.39 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.23 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  31.76 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  24.5 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  24.5 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  29.5 
 
 		 257 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  28.27 
 
 		 254 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.93 
 
 		 268 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 		 250 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.51 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.94 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  26.51 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  28.51 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  27.72 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  29.52 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  23.32 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  32.16 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.94 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  29.03 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  29.84 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  28.28 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  26.12 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  30.58 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  26.12 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  26.32 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  26.12 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  26.12 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0283  ABC transporter related  29.27 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  30.67 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 		 636 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0592  ABC transporter related  30.43 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  21.63 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  26.2 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 240 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0877  polar amino acid ABC transporter ATPase  29.49 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00896077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  29.29 
 
 		 244 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  27.54 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  28.07 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  25.19 
 
 		 251 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  25.71 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 252 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 240 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  29.07 
 
 		 357 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  29.07 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  27.05 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  29.82 
 
 		 253 aa  76.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  28.81 
 
 		 242 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>