More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0182 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 277 aa  577  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  92.06 
 
 		 277 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  90.61 
 
 		 277 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  90.25 
 
 		 281 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  90.25 
 
 		 277 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  90.61 
 
 		 277 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  88.45 
 
 		 277 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  88.09 
 
 		 277 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  86.64 
 
 		 277 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  86.28 
 
 		 277 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  86.64 
 
 		 277 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  78.1 
 
 		 276 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.2 
 
 		 285 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  71.38 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  71.38 
 
 		 285 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  74.51 
 
 		 272 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 		 272 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  73.56 
 
 		 272 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.71 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  74.12 
 
 		 272 aa  407  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  71.48 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.59 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  71.22 
 
 		 264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  72.73 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  73.62 
 
 		 272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  71.48 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  70.22 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  71.11 
 
 		 272 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 273 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  72.44 
 
 		 272 aa  394  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  68.23 
 
 		 284 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  70.47 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  68.6 
 
 		 261 aa  377  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  68.9 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  69.69 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  68.22 
 
 		 260 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  68.83 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  67.46 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  67.32 
 
 		 268 aa  361  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.2 
 
 		 251 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.34 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.21 
 
 		 253 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  65.87 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  66.02 
 
 		 257 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  64.29 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.68 
 
 		 253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 251 aa  352  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 		 251 aa  351  8e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  67.9 
 
 		 256 aa  351  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  67.21 
 
 		 252 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  65.5 
 
 		 258 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.8 
 
 		 252 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 		 252 aa  348  5e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 257 aa  348  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 258 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.34 
 
 		 253 aa  348  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.7 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  69.42 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.6 
 
 		 253 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  67.61 
 
 		 303 aa  346  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.59 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.08 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 258 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 		 262 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>