More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1347 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  99.62 
 
 
262 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  86.3 
 
 
270 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  77.12 
 
 
271 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  77.12 
 
 
271 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  76.75 
 
 
271 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  76.01 
 
 
271 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  76.25 
 
 
272 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  75.86 
 
 
272 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
272 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  75.38 
 
 
272 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  75.68 
 
 
272 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
264 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  73.36 
 
 
272 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
272 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
272 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
272 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  74.13 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.2 
 
 
279 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  72.14 
 
 
273 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  71.76 
 
 
272 aa  391  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 
277 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 
277 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 
277 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 
277 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
281 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  69.8 
 
 
285 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.87 
 
 
276 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  71.08 
 
 
285 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 
277 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
277 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  69.69 
 
 
272 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  69.29 
 
 
277 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
277 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  69.02 
 
 
277 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 
276 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  68.63 
 
 
283 aa  364  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  66.41 
 
 
268 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  70.04 
 
 
284 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  69.26 
 
 
277 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
261 aa  344  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.06 
 
 
253 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
258 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 
256 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  65.7 
 
 
255 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
252 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  64.96 
 
 
257 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 
253 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62 
 
 
253 aa  328  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  61.6 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 
253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.04 
 
 
253 aa  325  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.91 
 
 
260 aa  323  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
251 aa  323  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
252 aa  323  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
251 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
276 aa  322  4e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
251 aa  322  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
255 aa  321  7e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 
251 aa  321  8e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.37 
 
 
273 aa  321  8e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 
252 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.73 
 
 
251 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 
267 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.13 
 
 
251 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
251 aa  318  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.96 
 
 
254 aa  318  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 
260 aa  318  5e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 
251 aa  318  5e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.99 
 
 
292 aa  318  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
254 aa  318  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  62.81 
 
 
262 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  59.29 
 
 
260 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 
258 aa  316  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 
253 aa  316  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
260 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 
286 aa  315  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 
262 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2441  phosphate transporter ATP-binding protein  55.77 
 
 
264 aa  315  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.593551  normal  0.0208072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
249 aa  314  8e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  60.41 
 
 
249 aa  314  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1096  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.32 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.53322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.71 
 
 
254 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1565  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.95 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.133599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.29 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>