More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2942 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  97.42 
 
 
271 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  81.92 
 
 
271 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  80.44 
 
 
271 aa  454  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  78.23 
 
 
270 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  77.12 
 
 
270 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  77.12 
 
 
270 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  78.93 
 
 
262 aa  427  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  72.41 
 
 
272 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  72.03 
 
 
272 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 
273 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
272 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  68.91 
 
 
272 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
272 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 
272 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
264 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
272 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
272 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  72.44 
 
 
277 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  69.38 
 
 
279 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 
277 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 
277 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
277 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  65.44 
 
 
272 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.59 
 
 
276 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  69.8 
 
 
277 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
277 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  67.72 
 
 
285 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  66.28 
 
 
268 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
277 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  69.02 
 
 
277 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  67.87 
 
 
285 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  68.24 
 
 
281 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  68.24 
 
 
277 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  68.42 
 
 
284 aa  359  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  67.58 
 
 
283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  65.88 
 
 
276 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  65.73 
 
 
260 aa  350  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  62.11 
 
 
258 aa  345  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 
261 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 
253 aa  341  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 
255 aa  341  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  68.09 
 
 
277 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  61.94 
 
 
251 aa  333  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  62 
 
 
252 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.95 
 
 
253 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.37 
 
 
251 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.79 
 
 
252 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 
253 aa  332  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.2 
 
 
251 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
258 aa  328  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 
267 aa  328  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 
255 aa  328  8e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2441  phosphate transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.593551  normal  0.0208072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 
293 aa  326  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.54 
 
 
253 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
273 aa  325  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  63.39 
 
 
257 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 
249 aa  323  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
253 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.04 
 
 
292 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 
262 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.08 
 
 
254 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 
262 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 
251 aa  322  4e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
254 aa  322  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.3 
 
 
252 aa  322  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.54 
 
 
251 aa  321  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.13 
 
 
252 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.54 
 
 
253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 
260 aa  319  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
262 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1307  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.390273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.43 
 
 
249 aa  318  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.15 
 
 
286 aa  318  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0482  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 
253 aa  318  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0779  phosphate transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 
274 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1096  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.98 
 
 
259 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.53322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 
253 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
255 aa  317  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  59.29 
 
 
254 aa  317  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 
254 aa  317  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  60.08 
 
 
260 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 
255 aa  317  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 
260 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 
271 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
251 aa  316  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 
271 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>