More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0369 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  100 
 
 		 478 aa  968    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  38.68 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0560  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  28.05 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  34.19 
 
 		 252 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  29.69 
 
 		 255 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0371  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 		 252 aa  105  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.959364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30 
 
 		 246 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1303  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.2 
 
 		 259 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.673171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 264 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl235  phosphate ABC transporter ATP-binding component  28.98 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 		 255 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  24.79 
 
 		 248 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  29.84 
 
 		 252 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  27.49 
 
 		 265 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 247 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 277 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 253 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  32.78 
 
 		 244 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  29.1 
 
 		 253 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  31.82 
 
 		 251 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 		 251 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  32.42 
 
 		 265 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  31.25 
 
 		 257 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 		 302 aa  99.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  29.96 
 
 		 242 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 277 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  31.08 
 
 		 247 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  29.96 
 
 		 242 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.57 
 
 		 256 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  31.25 
 
 		 259 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1061  ABC transporter related  33.63 
 
 		 257 aa  99.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0787391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 256 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 		 277 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3272  phosphate transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 255 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  32.43 
 
 		 244 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.23 
 
 		 301 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2686  phosphate transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0630967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.34 
 
 		 290 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  28.28 
 
 		 253 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 281 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  31.33 
 
 		 244 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.2 
 
 		 253 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0223  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.78 
 
 		 260 aa  98.2  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00787996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 		 265 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.91 
 
 		 251 aa  97.8  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 252 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 		 251 aa  97.1  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 284 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  28.63 
 
 		 256 aa  96.7  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 		 250 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.2 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.31 
 
 		 284 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.73 
 
 		 291 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0190  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.63 
 
 		 329 aa  96.3  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.21 
 
 		 267 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 		 249 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  30.49 
 
 		 257 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 257 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  29.15 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2341  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  29.13 
 
 		 271 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.113454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 		 286 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 		 271 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0592  ABC transporter related  32.68 
 
 		 288 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 262 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  27.08 
 
 		 252 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.1 
 
 		 252 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  27.24 
 
 		 261 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  31.4 
 
 		 257 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  30 
 
 		 245 aa  94.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 284 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 277 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.21 
 
 		 286 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29.57 
 
 		 250 aa  94.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 253 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.08 
 
 		 287 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2546  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 289 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  26.56 
 
 		 244 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  26.94 
 
 		 249 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 244 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  32.62 
 
 		 235 aa  93.6  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  25.82 
 
 		 248 aa  94  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  30.33 
 
 		 248 aa  93.6  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 		 245 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.69 
 
 		 282 aa  93.6  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  25.73 
 
 		 262 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  26.14 
 
 		 273 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  30.8 
 
 		 248 aa  93.2  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.33 
 
 		 245 aa  93.6  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  31.4 
 
 		 266 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>