More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1602 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 		 253 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.29 
 
 		 252 aa  381  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.26 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.68 
 
 		 251 aa  377  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2564  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.26 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.97 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.35 
 
 		 252 aa  367  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  68.55 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  67.34 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.53 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 253 aa  358  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 253 aa  358  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.4 
 
 		 260 aa  357  9e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.48 
 
 		 249 aa  357  9e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  65.86 
 
 		 249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  67.74 
 
 		 251 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.06 
 
 		 249 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  66.13 
 
 		 258 aa  348  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2838  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.34 
 
 		 265 aa  345  4e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 251 aa  341  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.11 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28110  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 		 250 aa  339  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  62.75 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.79 
 
 		 287 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.85 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.2 
 
 		 284 aa  338  5e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0229  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 251 aa  338  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.06 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  64.78 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  62 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_002936  DET0141  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 		 251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2121  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.29 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.35 
 
 		 286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  62.35 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.75 
 
 		 276 aa  334  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0223  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 260 aa  334  7.999999999999999e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00787996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4349  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4171  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4009  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4019  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4493  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4289  phosphate transporter ATP-binding protein  65.57 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  65.16 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 		 275 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1826  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.97 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.1 
 
 		 293 aa  329  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 271 aa  329  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.56 
 
 		 272 aa  328  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0184  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.22 
 
 		 278 aa  328  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 264 aa  328  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  60.41 
 
 		 272 aa  328  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  60.41 
 
 		 272 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 		 277 aa  327  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 272 aa  327  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1447  phosphate transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1476  phosphate transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.29 
 
 		 269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.04 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  60.41 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.24 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1666  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.26 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000112485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.8 
 
 		 267 aa  325  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 252 aa  325  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  60.89 
 
 		 249 aa  325  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.38 
 
 		 305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0779  phosphate transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 274 aa  324  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>