More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4327 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  84.15 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 		 265 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 		 265 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  81.89 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  81.13 
 
 		 265 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  74.2 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  71.86 
 
 		 271 aa  397  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74 
 
 		 263 aa  397  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  72.41 
 
 		 271 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.15 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  73.49 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  69.73 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  70.7 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  69.73 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  71.83 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  71.83 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  67.77 
 
 		 273 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.89 
 
 		 265 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 275 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  70.28 
 
 		 293 aa  377  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  70.24 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  71.54 
 
 		 247 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  69.48 
 
 		 295 aa  374  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.33 
 
 		 253 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.86 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.27 
 
 		 290 aa  358  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 		 252 aa  354  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.53 
 
 		 273 aa  351  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.15 
 
 		 251 aa  346  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 		 254 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.35 
 
 		 276 aa  343  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  58.5 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 		 262 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.89 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  61.45 
 
 		 254 aa  341  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.19 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 		 255 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.68 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 261 aa  338  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 		 251 aa  338  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 253 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 		 253 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 269 aa  337  8e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  61.72 
 
 		 272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  60.94 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 		 253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.66 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 285 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.47 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 		 253 aa  334  9e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  60.55 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.42 
 
 		 292 aa  333  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 		 253 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 277 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  60.23 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.69 
 
 		 285 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  57.59 
 
 		 273 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 272 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.24 
 
 		 254 aa  331  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.05 
 
 		 252 aa  331  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 		 251 aa  331  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 286 aa  329  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.77 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  59.7 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  59.38 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  59.7 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 271 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  61.79 
 
 		 271 aa  329  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01640  PstB  60.55 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>