43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3638 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  100 
 
 
168 aa  347  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  38.89 
 
 
165 aa  141  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  39.26 
 
 
164 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  37.42 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  39.38 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  41.82 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  39.88 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  36.53 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  34.29 
 
 
197 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  34.09 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.19 
 
 
490 aa  99  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  36.88 
 
 
163 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.93 
 
 
505 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.59 
 
 
508 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  32.26 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  28.25 
 
 
209 aa  80.9  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  30.16 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  26.29 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  25.58 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.67 
 
 
189 aa  57.4  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.78 
 
 
438 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  25.95 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  29.75 
 
 
419 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  28.47 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  28.46 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  25.45 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
500 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  47.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  27.1 
 
 
369 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.99 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1286  dual specificity protein phosphatase  34.67 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  26.57 
 
 
507 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  33.93 
 
 
478 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  26.05 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  28.81 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60110  Protein tyrosine phosphatase CDC14  27.52 
 
 
562 aa  41.2  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248188  normal  0.566685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  26.06 
 
 
540 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  27.12 
 
 
547 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1671  dual specificity protein phosphatase  29.59 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00163756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>