60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3816 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3816  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
163 aa  330  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2331  protein tyrosine phosphatase, catalytic region  98.77 
 
 
163 aa  327  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  40.76 
 
 
170 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  43.83 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00295  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  40.37 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  40.74 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  40.74 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002127  predicted protein-tyrosine phosphatase  40.99 
 
 
164 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  37.5 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2817  hypothetical protein  40.62 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.59 
 
 
508 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.18 
 
 
505 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  28.22 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  30.3 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  30.59 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  26.59 
 
 
209 aa  73.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  31.58 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  27.81 
 
 
490 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2388  dual specificity protein phosphatase  29.48 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  31.14 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  29.3 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  27.89 
 
 
438 aa  60.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  26.87 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  26.95 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  41.25 
 
 
222 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 
197 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  28.12 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  27.34 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  29.84 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  26.81 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  26.67 
 
 
121 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1139  dual specificity protein phosphatase  24.03 
 
 
140 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0167  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.89 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1786  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.48 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  28.57 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  30.7 
 
 
158 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  27.87 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  27.05 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.34251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  31.03 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  28.79 
 
 
507 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.12 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  27.73 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34403  predicted protein  28.7 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  25.41 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  25.64 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 
298 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  30 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  26.89 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2191  phosphatase-like protein  29.34 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  44.19 
 
 
238 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  31.78 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  25.77 
 
 
565 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  25.77 
 
 
565 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  25.77 
 
 
565 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>