14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1071 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  85.19 
 
 		 206 aa  332  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  61.38 
 
 		 176 aa  188  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  36.36 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  38.64 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  35.23 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  38.55 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  32.61 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  29.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  33.66 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.37 
 
 		 439 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  29.51 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  25.25 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  28.8 
 
 		 431 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>