16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1387 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  61.38 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  61.38 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  36.22 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  32.99 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  29.6 
 
 		 431 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  29.9 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  28.7 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  28.43 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  28.18 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  30.39 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  27.18 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  43.4 
 
 		 117 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  36 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  35.64 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>