22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3576 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  49.18 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  52.63 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  39.34 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  41.52 
 
 		 178 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  40.14 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  37.76 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  30.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  30.39 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30.1 
 
 		 431 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  28.43 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  22.22 
 
 		 693 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  29.05 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  27.54 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  29.36 
 
 		 555 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  25.25 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  29.36 
 
 		 556 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  29.36 
 
 		 556 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  29.36 
 
 		 556 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>