19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4436 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  100 
 
 
157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  46.36 
 
 
178 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  39.52 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  40.14 
 
 
193 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  41.94 
 
 
180 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  37.5 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  32.64 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  31.25 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  30.17 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  31.15 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  27.66 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  28.7 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  27.08 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1671  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30 
 
 
431 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  27.34 
 
 
693 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.778829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>