59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0813 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  338  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  79.39 
 
 		 165 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  59.03 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  28 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  33.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  32.58 
 
 		 142 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  33.65 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  27.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.73 
 
 		 439 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  33.66 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  29.41 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  28.72 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  28.12 
 
 		 556 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  28.43 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  26.32 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  23.14 
 
 		 141 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  27.72 
 
 		 554 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  26.61 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  33 
 
 		 555 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  28.46 
 
 		 555 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  22.86 
 
 		 432 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  30.86 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  28.23 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  28.72 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  29.09 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  27.66 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  29.01 
 
 		 556 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  29.01 
 
 		 556 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  27.69 
 
 		 556 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  31.52 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  27.72 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  27.18 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  26.61 
 
 		 554 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  24 
 
 		 557 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  28.46 
 
 		 559 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  26.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  26.23 
 
 		 693 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  32.5 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  25.74 
 
 		 554 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  28 
 
 		 567 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.13 
 
 		 556 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  26.73 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  28.77 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  26.92 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  28 
 
 		 111 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  29.47 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  26.36 
 
 		 556 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  26.36 
 
 		 556 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  26.21 
 
 		 559 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  30.69 
 
 		 116 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  29.92 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  24.75 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>