74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2642 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  46.48 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  46.04 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  43.94 
 
 
143 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  43.94 
 
 
143 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  40.85 
 
 
156 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  37.4 
 
 
555 aa  95.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  42.99 
 
 
114 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  37.21 
 
 
556 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  37.21 
 
 
556 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  39.5 
 
 
555 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  36.43 
 
 
556 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.23 
 
 
556 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  36.36 
 
 
556 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  36.36 
 
 
556 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  37.01 
 
 
1496 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  35.56 
 
 
559 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  41.82 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  41.82 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  37.32 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  36.54 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  37.96 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
557 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  36.51 
 
 
558 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  35.85 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  32.82 
 
 
551 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  39.42 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  34.62 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  36.3 
 
 
559 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  37.38 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  31.58 
 
 
554 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  32.54 
 
 
554 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  31.58 
 
 
554 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  34.51 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  35.21 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  34.51 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  28.37 
 
 
567 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  28.57 
 
 
556 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  33.8 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  37.5 
 
 
539 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  36.45 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  36.56 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  29.17 
 
 
557 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  39.36 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  33.67 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  29.47 
 
 
492 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  34.69 
 
 
492 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  34.69 
 
 
492 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  27.34 
 
 
431 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  34.69 
 
 
492 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  27.48 
 
 
432 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  27.52 
 
 
501 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  34.69 
 
 
494 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.5 
 
 
439 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  33.67 
 
 
494 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  29.41 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  31.07 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  30.21 
 
 
492 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  36.56 
 
 
492 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  29.7 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  33.03 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  26.67 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  29.47 
 
 
492 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  47.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  29.7 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  31.43 
 
 
426 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  30.22 
 
 
426 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  30.91 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>