78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2123 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  80.36 
 
 		 112 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  81.98 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  74.77 
 
 		 111 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  52.38 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  48.57 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  39.42 
 
 		 558 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  39.42 
 
 		 554 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  41.35 
 
 		 556 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 492 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  41.35 
 
 		 551 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44.44 
 
 		 557 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  46.08 
 
 		 494 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 494 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  43.69 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  43.4 
 
 		 554 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  37.5 
 
 		 556 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  42.45 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  43.14 
 
 		 492 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  43.14 
 
 		 492 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  42.39 
 
 		 492 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  43.14 
 
 		 492 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  38.39 
 
 		 567 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  37.5 
 
 		 554 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  40.38 
 
 		 555 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.42 
 
 		 556 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  38.46 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  39.39 
 
 		 492 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  40.22 
 
 		 492 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  38.46 
 
 		 556 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  38.46 
 
 		 556 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  40.38 
 
 		 555 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  43.14 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1496 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  36.19 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 501 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  37.5 
 
 		 557 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  42.59 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  38.24 
 
 		 556 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  39.42 
 
 		 559 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  39.42 
 
 		 559 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  38.24 
 
 		 556 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  38.24 
 
 		 556 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  40.78 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  35.78 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  34.62 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  36.27 
 
 		 539 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  34.95 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  35.58 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  34.62 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  39.22 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  37.11 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  35.58 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  39.42 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  33.65 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  33.65 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  27.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  31.43 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  31.07 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  30.77 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  27.18 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  27.45 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  27.1 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  32.69 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  26 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  26.21 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  26.53 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  26.73 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.25 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  32.61 
 
 		 166 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>