83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2071 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  229  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  96.36 
 
 
110 aa  195  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  76.36 
 
 
110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  52.63 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  41.35 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  42.86 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  38.89 
 
 
108 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  38.24 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  43 
 
 
127 aa  84.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  39.62 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  37.37 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  37.37 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  34.34 
 
 
554 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  37.37 
 
 
1496 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  34.91 
 
 
431 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  32.32 
 
 
554 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  36.89 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  37.11 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  39.62 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  34.95 
 
 
567 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  32.65 
 
 
554 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  40.62 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  35.29 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  42.16 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  32.04 
 
 
558 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  37.62 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  37.86 
 
 
539 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  33.01 
 
 
557 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  33.33 
 
 
492 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  34.34 
 
 
551 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  39.53 
 
 
492 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  35.29 
 
 
492 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.36 
 
 
557 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  34.31 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  30.1 
 
 
556 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  33.64 
 
 
555 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  38.54 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  36.36 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  32.32 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  38.37 
 
 
494 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  30.1 
 
 
555 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  34.34 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  31.78 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  38.37 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  35.11 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  39 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  30.84 
 
 
559 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  37.21 
 
 
492 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  37.21 
 
 
492 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  37.21 
 
 
492 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  29.73 
 
 
556 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  29.73 
 
 
556 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29.25 
 
 
432 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  29.73 
 
 
556 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  44.21 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  34.04 
 
 
492 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  37.37 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  30.1 
 
 
556 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  34.31 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  32.04 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  36.56 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  33.98 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  32.98 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  36.27 
 
 
426 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  29.41 
 
 
501 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  34.31 
 
 
426 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  31.96 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.3 
 
 
439 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  29.91 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  24.24 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  25.25 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  26.37 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  31.11 
 
 
241 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  32 
 
 
164 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>