55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3047 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  257  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  43.65 
 
 
157 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  36.51 
 
 
141 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  38.89 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  31.75 
 
 
166 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  27.93 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  29.2 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  30.17 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  28.95 
 
 
554 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  28.87 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  28.43 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  27.45 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  25.83 
 
 
241 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  32.32 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  32.67 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  28.28 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  31.73 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  33.7 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  27.45 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  27.72 
 
 
558 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  28.07 
 
 
556 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  27.19 
 
 
554 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  31.63 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  29.13 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  26.09 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  30.36 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.37 
 
 
431 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  24.79 
 
 
241 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  22.22 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  28.71 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  26.96 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  26.96 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  26.96 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  29.07 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  25.25 
 
 
244 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  29.13 
 
 
567 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  25.49 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  29.09 
 
 
557 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  23.21 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  26.04 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  22.32 
 
 
114 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  21.43 
 
 
114 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  23.89 
 
 
554 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  29.55 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  28.97 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  25.69 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  24.44 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  26.5 
 
 
693 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  28.97 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  26.85 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  23.53 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  23.53 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>