55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1184 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  79.39 
 
 		 165 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  59.59 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  29.6 
 
 		 431 aa  75.1  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  36.57 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  34.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  36.57 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  33.88 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  37.5 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.4 
 
 		 439 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  32.35 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  31.37 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  29.41 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  24.19 
 
 		 432 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  25.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  32.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  32.61 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  28.71 
 
 		 554 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  30.97 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  26.83 
 
 		 693 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  33.61 
 
 		 558 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  26.56 
 
 		 556 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  34.96 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  34.31 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  30.85 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  29.13 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  30 
 
 		 556 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  32.98 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  24.6 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  30 
 
 		 556 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  30 
 
 		 556 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  37.93 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  29.35 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  26.77 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  28.23 
 
 		 554 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  29.23 
 
 		 555 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  33 
 
 		 555 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  27.08 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  27.72 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  30.53 
 
 		 559 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  27.72 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  27.18 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  28.71 
 
 		 554 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  26.73 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  23.2 
 
 		 557 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  28.71 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  45.65 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  22.66 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>