96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1253 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  98.59 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  90.14 
 
 		 142 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  46.1 
 
 		 431 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  47.45 
 
 		 432 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.76 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  51.41 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  50 
 
 		 426 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  40.85 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.96 
 
 		 557 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  39.86 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  47.24 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  37.88 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  44.53 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  39.26 
 
 		 556 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  41.54 
 
 		 555 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  44.26 
 
 		 556 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  44.26 
 
 		 556 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  40.62 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  44.63 
 
 		 559 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  39.67 
 
 		 555 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  37.78 
 
 		 558 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  36.57 
 
 		 165 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  37.14 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  40.85 
 
 		 556 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  41.27 
 
 		 556 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  34.09 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  43.8 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  41.12 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  37.88 
 
 		 551 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  44.03 
 
 		 557 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  43.48 
 
 		 567 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.3 
 
 		 556 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  36.3 
 
 		 556 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  35.97 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  36.3 
 
 		 556 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  42.06 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  34.07 
 
 		 554 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  36.36 
 
 		 554 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  41.12 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1496 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  31.73 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  35.56 
 
 		 554 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  41.35 
 
 		 539 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  34.65 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  40.43 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  35.24 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  38.54 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  34.62 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  38.54 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  42.55 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  39.42 
 
 		 501 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  39.22 
 
 		 492 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 494 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  33.65 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  40 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  36.46 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  41.11 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  41.11 
 
 		 492 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  37.25 
 
 		 492 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  41.11 
 
 		 492 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  32.69 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  32.69 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  42.45 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  43.27 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  39.13 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  35.96 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  35.29 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  38.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  29.17 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  36.67 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  28.42 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  36.78 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  23.53 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  30 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  27.13 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  28.57 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  28.3 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  30.69 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  30.11 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  58.06 
 
 		 1244 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  32.63 
 
 		 206 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  32.18 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  33.68 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1671  hypothetical protein  26.19 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  43.1 
 
 		 1269 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>