14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4078 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  59.54 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  52.63 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  46.29 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  39.52 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  28.75 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30.25 
 
 		 431 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  33.66 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  28.18 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  30.93 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  24.32 
 
 		 161 aa  41.2  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>