18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0090 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0073  hypothetical protein  80.45 
 
 		 178 aa  298  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4078  hypothetical protein  46.29 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  39.34 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0545  hypothetical protein  45.03 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  41.94 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  32.19 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  32.2 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  38.64 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  32.99 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.99 
 
 		 439 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  28.32 
 
 		 431 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  28.12 
 
 		 432 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4281  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  32.22 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0373  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  32.22 
 
 		 258 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  27 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>