69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2070 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  226  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  90.74 
 
 
108 aa  209  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  150  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  42.86 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  37.96 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  37.25 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  42.11 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  37.89 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  32.41 
 
 
558 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  33.68 
 
 
492 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  33.68 
 
 
492 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  35.05 
 
 
492 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  32.63 
 
 
492 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  31.31 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  35.92 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  35.71 
 
 
557 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  30.3 
 
 
554 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  32.63 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  31.31 
 
 
554 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  32.63 
 
 
494 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  34.65 
 
 
492 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  36.27 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  31.43 
 
 
554 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  30.3 
 
 
556 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  30.3 
 
 
556 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 
556 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  30.3 
 
 
1496 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  31.87 
 
 
492 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  35.92 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.31 
 
 
431 aa  59.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  28.71 
 
 
556 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  31.58 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  31 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  27.27 
 
 
556 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  30.3 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  27.27 
 
 
555 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  28.28 
 
 
559 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  30.3 
 
 
555 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  27.27 
 
 
556 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  27.27 
 
 
556 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  25.47 
 
 
551 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  27.18 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  29.13 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  26.26 
 
 
559 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  29.13 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  28 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  28 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  32.67 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  27.27 
 
 
432 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  31.13 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  27.37 
 
 
157 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  29.47 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  29.47 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  31.07 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  26.85 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  21.57 
 
 
501 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  26.42 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  25.49 
 
 
539 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  32.35 
 
 
136 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.31 
 
 
439 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  24.24 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  24.51 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  22.22 
 
 
557 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  26.47 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>