85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1784 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  75.24 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  49.55 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  45.45 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  44.55 
 
 		 554 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  48.15 
 
 		 558 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2281  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 556 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.547695  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 551 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2117  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  45.71 
 
 		 556 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2173  pyridine nucleotide-disulfide family oxidoreductase  45.71 
 
 		 556 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5044  hypothetical protein  44.55 
 
 		 555 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2303  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1496 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  40.18 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  40.91 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1762  hypothetical protein  44.44 
 
 		 556 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1746  hypothetical protein  44.44 
 
 		 556 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6333  hypothetical protein  44.44 
 
 		 556 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1667  hypothetical protein  45.54 
 
 		 559 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  36.61 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1670  hypothetical protein  44.64 
 
 		 559 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  46.79 
 
 		 557 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  41.9 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  40 
 
 		 554 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  36.61 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  39.29 
 
 		 556 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  44.55 
 
 		 567 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6238  hypothetical protein  48.18 
 
 		 556 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1514  hypothetical protein  42.86 
 
 		 555 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18624  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42 
 
 		 557 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  42.73 
 
 		 501 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  47.25 
 
 		 492 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  40.19 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1318  hypothetical protein  50.98 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  46.94 
 
 		 492 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  39.62 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  46.94 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  46.94 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  46.94 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  47.27 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  39.62 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  46.94 
 
 		 492 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  45.92 
 
 		 494 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1410  protein of unknown function DUF442  40.35 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0423745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  39.62 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  35.92 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  41.9 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 492 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  33.98 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  31.53 
 
 		 432 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  34.95 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3143  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0459461  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  42.45 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  41.51 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2602  hypothetical protein  35.58 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.580071  hitchhiker  0.0000000616636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  40.19 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1162  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4702  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.982196  normal  0.310947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  42.45 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1505  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  34.34 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.19 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  32.35 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  30.48 
 
 		 539 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  32.65 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  33.66 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2642  hypothetical protein  30.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448254  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  35.78 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  41.12 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  31.25 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  42.5 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  28.28 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  34.65 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  32.67 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>