57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4158 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  43.65 
 
 
127 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  41.91 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  40.43 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  35.82 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  33.88 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  28.93 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  35 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  34 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  35.71 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  31.15 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  26.36 
 
 
554 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  30.33 
 
 
193 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  30.16 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  26 
 
 
112 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  29 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  30.3 
 
 
117 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  27.34 
 
 
431 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3588  hypothetical protein  28.3 
 
 
558 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  26.09 
 
 
556 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  28 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  26.19 
 
 
432 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  25.4 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  22.83 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  27.91 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  27.66 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  25.45 
 
 
554 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  25.24 
 
 
241 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  24.81 
 
 
202 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1793  hypothetical protein  28.42 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.485796  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  23.49 
 
 
182 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  28.7 
 
 
221 aa  47.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  29.87 
 
 
693 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  22.83 
 
 
554 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  29.17 
 
 
492 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  28.87 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  27.16 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4148  protein of unknown function DUF442  25.4 
 
 
557 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1235  hypothetical protein  29.63 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0090  hypothetical protein  28.7 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  26.21 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2071  hypothetical protein  30.85 
 
 
110 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0992889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1794  hypothetical protein  29.59 
 
 
110 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.146187  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.36 
 
 
557 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  26.83 
 
 
243 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.47 
 
 
439 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  28.28 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2234  hypothetical protein  27.37 
 
 
110 aa  40.8  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000227928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  25.49 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3839  hypothetical protein  24.6 
 
 
567 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.359472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>