37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1518 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  40.85 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  40.18 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  37.61 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  40.38 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  40.45 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  37.56 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  37.56 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  37.56 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  38.5 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  38.83 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  38.83 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  37.25 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  36.82 
 
 		 244 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  32.42 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  37.66 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  38.17 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  31.29 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  31.45 
 
 		 693 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  27.93 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  27.69 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  29.66 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  27.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  27.74 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  34.62 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  26.72 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  28.47 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  26.12 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  30.68 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1562  dual specificity protein phosphatase  25.69 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257476  hitchhiker  0.00837584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  31.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  26.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61269  tyrosine phosphatase  33.64 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.115232  normal  0.236513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>