28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1223 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  92.17 
 
 		 218 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  51.94 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  48.6 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  37.44 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  37.14 
 
 		 693 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  32.22 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  29.03 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30.89 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  30.89 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  29.22 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  29.46 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58142  putative tyrosine phosphatase  25.79 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973876  normal  0.993909 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  26.32 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  32.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  34.58 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02810  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568047  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61269  tyrosine phosphatase  21.95 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.115232  normal  0.236513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  26.72 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  30.23 
 
 		 166 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  28.75 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46361  protein tyrosine/serine phosphatase  26.14 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  37.29 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  30.26 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>