24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1524 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  48.47 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  36.36 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  30.73 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  36.24 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  34.44 
 
 		 693 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  34.97 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  32 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  30.14 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  27.92 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  34.53 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  36.76 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  29.93 
 
 		 244 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  26.79 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  25.35 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  27.82 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  28.97 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  28.86 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  31.9 
 
 		 229 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  33.78 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  36.17 
 
 		 260 aa  41.6  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  42.31 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>