59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0322 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  100 
 
 
166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1387  hypothetical protein  36.22 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320247  unclonable  0.0000000003628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1071  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00010932  normal  0.551694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  35.82 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2144  hypothetical protein  32.79 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.423368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1307  hypothetical protein  33.88 
 
 
206 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000128549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  33.65 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  31.75 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 
244 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  35.2 
 
 
226 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  28.89 
 
 
141 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  34.86 
 
 
202 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  29.66 
 
 
431 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  28.87 
 
 
432 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1801  hypothetical protein  39.18 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0167  hypothetical protein  38.14 
 
 
143 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  29.13 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  39.13 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  34.04 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  36.08 
 
 
114 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  36.08 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 
223 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.04 
 
 
439 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  30.69 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  30.33 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 
244 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  36.56 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  36.96 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  28.71 
 
 
241 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  27.05 
 
 
221 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  31.91 
 
 
218 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  29 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  34.62 
 
 
556 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  25.6 
 
 
693 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  35.92 
 
 
492 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1476  hypothetical protein  37.11 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  30.23 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  31.45 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  32.69 
 
 
232 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  36.23 
 
 
426 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0882  hypothetical protein  32.97 
 
 
365 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  31.68 
 
 
204 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03332  hypothetical protein  30.51 
 
 
228 aa  44.7  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  34.44 
 
 
114 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  34.95 
 
 
241 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  34.96 
 
 
182 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  32.38 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  32.38 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4024  hypothetical protein  35.43 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2334  hypothetical protein  32.26 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  23.26 
 
 
189 aa  42  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  30.17 
 
 
557 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  26.15 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0380  hypothetical protein  26.21 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>