59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0085 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  65.08 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  30.65 
 
 		 693 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  41.13 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  32.81 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  31.91 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  36.07 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  33.54 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  30.89 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  30.89 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  36.76 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  26.12 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  28.21 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  29.63 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61269  tyrosine phosphatase  26.36 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.115232  normal  0.236513 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  31.53 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  34.86 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  32.56 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  29.2 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  27.03 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04520  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000490749  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02810  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568047  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58142  putative tyrosine phosphatase  25.93 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973876  normal  0.993909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  35.77 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  29.22 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  29.82 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  26.5 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  24.81 
 
 		 157 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46361  protein tyrosine/serine phosphatase  24.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04310  cytoplasm protein, putative  22.83 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.060224  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  24.34 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  26.72 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  26.5 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  28.47 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  33.03 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  25.34 
 
 		 346 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  25.49 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  29.13 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  26.32 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  29.13 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  31.07 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  31.82 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  26.71 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  29.13 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61589  predicted protein  24.83 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  28.21 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  26.47 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  27.05 
 
 		 370 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  31.71 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>