35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3253 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  42.2 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  42.2 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  40.18 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  45.37 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  42.99 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  42.99 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  42.99 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  44.39 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  43.18 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  39.09 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  35.45 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  36.82 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  35.78 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  34.4 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  36.56 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  35.44 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  37.86 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  24.83 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  28.33 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  31.65 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  29.63 
 
 		 693 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  34.51 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30.91 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  36.44 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  35.59 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  38.3 
 
 		 127 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  30.84 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  30.84 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  30.84 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  28.97 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  30.91 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29.47 
 
 		 432 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  28.97 
 
 		 156 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>