35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2901 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  87.55 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  79.25 
 
 		 241 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  79.25 
 
 		 241 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  79.25 
 
 		 241 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  78.42 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  45.79 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  45.81 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  46.61 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  40.85 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  41.98 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  48.98 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  45.15 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  41.26 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  41.26 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  33.94 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  38.35 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  37.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  29.2 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  33.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  32.74 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  31.39 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  32.74 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  32.74 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  26.12 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  31.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  32.04 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  29.36 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  29.1 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  30.4 
 
 		 182 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>