39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0803 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  29.22 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  37.5 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  31.79 
 
 
218 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  36.72 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
214 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  28.99 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  30.51 
 
 
693 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  33.08 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  29.77 
 
 
363 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  29.33 
 
 
183 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  28.66 
 
 
226 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  34.92 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0256  dual specificity protein phosphatase  37.33 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0541  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
244 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  34.38 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  31.43 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  26.36 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 
241 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  31.68 
 
 
232 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1603  dual specificity protein phosphatase  27.5 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  30.3 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  25.53 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  24.84 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  23.81 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0633  dual specificity protein phosphatase  36.36 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0827335  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  26.89 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0675  dual specificity protein phosphatase  31.94 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179301  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.53 
 
 
260 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3481  dual specificity protein phosphatase  41.07 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  21.32 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  26.62 
 
 
226 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  26.62 
 
 
226 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  28.91 
 
 
241 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  28.91 
 
 
241 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  28.91 
 
 
241 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>