39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2901 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  83.97 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  260  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  75 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  76.28 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  75.64 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  76.28 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  73.72 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  60.65 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  60.26 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  53.55 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  26.52 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  34.21 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  38.46 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  32.65 
 
 		 244 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.72 
 
 		 533 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.55 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  28.07 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  29.29 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2275  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  25.36 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  27.66 
 
 		 550 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2186  dual specificity protein phosphatase  30.36 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  28.85 
 
 		 155 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 568 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.35 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  38.78 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 		 239 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28.1 
 
 		 370 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  28.36 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  27.5 
 
 		 478 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>