25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2709 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2709  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 159 aa  333  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  65.81 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2494  dual specificity protein phosphatase  61.94 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2901  dual specificity protein phosphatase  60.65 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1370  dual specificity protein phosphatase  60.65 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  60.65 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2817  dual specificity protein phosphatase  58.71 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1560  dual specificity protein phosphatase  58.71 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620433  hitchhiker  0.00335641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2937  dual specificity protein phosphatase  58.71 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.77035  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3124  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  60 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1423  Dual specificity protein phosphatase  60 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2797  dual specificity protein phosphatase  58.06 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1746  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1455  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  61.29 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2203  tyrosine-specific protein phosphatase, putative  49.69 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1106  dual specificity protein phosphatase  37.5 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442811  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3944  dual specificity protein phosphatase  35.71 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.731785  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  25.56 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  26.49 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  32 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2580  dual specificity protein phosphatase  35.37 
 
 		 183 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254118  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  43.59 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1546  dual specificity protein phosphatase  25.34 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>