128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2349 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
246 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  37.8 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  39.43 
 
 
245 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  34.43 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  39.75 
 
 
302 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  38.58 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  35.43 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 
263 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  37.27 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  33.73 
 
 
257 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.29 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
238 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  32.24 
 
 
246 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  31.52 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  35.29 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28.69 
 
 
316 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
279 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  27.73 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  33.6 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  33.51 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  26.77 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  34.98 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.71 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.12 
 
 
340 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.12 
 
 
340 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.73 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  31.95 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.39 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  27.34 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  34.16 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.96 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.39 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  30.95 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.34 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  31.82 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  36.5 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  27.34 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.54 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  32.55 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  27.09 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  37.36 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  30.17 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  35.12 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  31.05 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  29.79 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  27.35 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  31.41 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  29.25 
 
 
344 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  31.75 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  29.36 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  32.32 
 
 
671 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  27.89 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  30.19 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  33.51 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.33 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  35.68 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  29.26 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  35.36 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  32.61 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  32.02 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30.54 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  26.9 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  31.6 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  31.93 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  34.5 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.32 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  32 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.2 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  36.21 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  30.29 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  29.67 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  37.87 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  34.12 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  29.78 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  31.54 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  36.16 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.52 
 
 
349 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.01 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  31.54 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  36.14 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  25.91 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  29.65 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  32.65 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  37.02 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  31.66 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>