126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3890 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  98 
 
 
264 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  73.68 
 
 
250 aa  348  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  60.58 
 
 
275 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  49.17 
 
 
247 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  45.16 
 
 
250 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  36.4 
 
 
260 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  36.19 
 
 
260 aa  135  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  36.48 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  36.63 
 
 
306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  35.6 
 
 
260 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  33.59 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  34.47 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  33.46 
 
 
342 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  35.2 
 
 
260 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  32.41 
 
 
316 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  33.08 
 
 
340 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  35.1 
 
 
339 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.97 
 
 
340 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.97 
 
 
340 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  34.69 
 
 
340 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  36.08 
 
 
295 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.46 
 
 
340 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.46 
 
 
340 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  30.83 
 
 
267 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  33.46 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  35.16 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  31.03 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  34.24 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  33.05 
 
 
269 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.88 
 
 
339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  35.06 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.08 
 
 
349 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  29.39 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  29.62 
 
 
263 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  34.45 
 
 
344 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
238 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  30.48 
 
 
306 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  32.06 
 
 
270 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  33.07 
 
 
260 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  30.3 
 
 
269 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  32.59 
 
 
269 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
243 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  28.47 
 
 
274 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  34.02 
 
 
637 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  27.96 
 
 
281 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  29.62 
 
 
267 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  35.1 
 
 
302 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  34.09 
 
 
265 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  34.42 
 
 
280 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  29.18 
 
 
243 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  35.04 
 
 
265 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  34.11 
 
 
265 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.89 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  27.34 
 
 
289 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  33.75 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  31.43 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  35.06 
 
 
274 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  32.2 
 
 
636 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 
283 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  32.92 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  30.95 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  33.73 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  32.99 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  35.74 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  31.01 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  30.29 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  34.44 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  32.02 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  33.16 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  27.78 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  35 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  34.21 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  30.36 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.08 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  31.43 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  31.52 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.3 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  33.65 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.29 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  25.66 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  26.63 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  31.43 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  29.15 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  28.68 
 
 
671 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  28.2 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  32.41 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  30.36 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>