126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2835 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
283 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  45.45 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  36.33 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  32.03 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  35.62 
 
 
243 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  30.98 
 
 
342 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 
247 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.98 
 
 
340 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  32.92 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  39.41 
 
 
221 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  30.98 
 
 
340 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  30.98 
 
 
340 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  32.02 
 
 
264 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  33.04 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.59 
 
 
340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.74 
 
 
340 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.74 
 
 
340 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.64 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.64 
 
 
339 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  32.33 
 
 
250 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.64 
 
 
339 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 
344 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32.93 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  30.71 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  29.39 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  30.47 
 
 
254 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  33.46 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  27.62 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  38.98 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  27.88 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  29.3 
 
 
349 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.43 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  29.29 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  32 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  26.88 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  34.98 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  31.66 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  34.06 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  31.3 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  33.63 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  30.46 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  25.67 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  28.05 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  29.93 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  36.22 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  32.77 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  26.97 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  31.93 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  29.44 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.63 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  25.64 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  32.57 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  29.24 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  38.41 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  32.4 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  27.46 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  32.16 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  28.39 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  27.04 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  27.35 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  35.59 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  26.79 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  25.94 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  32.21 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  36.6 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  32 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  32.07 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  34.5 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
636 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  23.77 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  32.49 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  32.58 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  27.87 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  21.4 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.91 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  33.5 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.46 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  26.12 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  33.1 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  26.52 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36571  predicted protein  23.71 
 
 
653 aa  58.9  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136589  normal  0.0275107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  26.72 
 
 
671 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  33.49 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  26.2 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  27.34 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>