127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5073 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
228 aa  453  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  42.86 
 
 
258 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  39.06 
 
 
234 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  36.21 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  38.02 
 
 
247 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0714  protein tyrosine/serine phosphatase  34.91 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  34.98 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  34.58 
 
 
260 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  34.47 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  36.53 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  28.94 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  39.11 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  34.86 
 
 
344 aa  92  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  33.5 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  31.56 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  33.14 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  31.7 
 
 
265 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  31.2 
 
 
251 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  32.35 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  26.47 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  29.11 
 
 
316 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  27.47 
 
 
267 aa  78.2  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.93 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  33.01 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.87 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  32.77 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  30.48 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  30.86 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  33.88 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  27.72 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  31.63 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  29.81 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  29.78 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  27.23 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  32.61 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  23.44 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  27.78 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  27.95 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  29.67 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  28.29 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.85 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3262  protein tyrosine/serine phosphatase  31.58 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.64 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  28.98 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  26.34 
 
 
671 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.95 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  34.09 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  35.6 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  26.01 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  25.1 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32.58 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  26.69 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  30.36 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  30.85 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  28.68 
 
 
295 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  30.1 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  29.94 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  29.37 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  29.35 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  26.89 
 
 
339 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  27.92 
 
 
250 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.32 
 
 
339 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 
349 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  29.12 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  27.09 
 
 
306 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  29.38 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  28.04 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.79 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  29.79 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  29.6 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  27.96 
 
 
289 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.79 
 
 
342 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
339 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  31.08 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.79 
 
 
340 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  29.38 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  26.83 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  30.17 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  26.57 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  25.27 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  26.57 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  26.57 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  29.59 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.3 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>