128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3477 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  71.02 
 
 
251 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  39.43 
 
 
246 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  40.15 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  40.08 
 
 
265 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  42.02 
 
 
263 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  36.76 
 
 
257 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  36.02 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  37.2 
 
 
249 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  38.78 
 
 
283 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  30.31 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  33.89 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 
246 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
247 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
260 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  32.22 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.06 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  33.53 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  30.86 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  30.94 
 
 
306 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  30.84 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  33.6 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  33.74 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  32.52 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  36.07 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  36.36 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  35.59 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  36.16 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  27.73 
 
 
298 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  38.12 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  25.38 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  26.44 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  37.13 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.44 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.44 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  37.77 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  29 
 
 
255 aa  79  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.05 
 
 
340 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  26.05 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  25.09 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  29.15 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  25 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.05 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  32.32 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  30.94 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.4 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.4 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  35.2 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  26.17 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  35.03 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.63 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  30.61 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  33.19 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  38.38 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  32.93 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  29.78 
 
 
671 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  26.69 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  26.52 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  25.59 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  25.6 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  34.46 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  27.16 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  36.67 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  31.02 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  30.47 
 
 
636 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  34.95 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  34.74 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  28.04 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30.18 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  33.85 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  29.53 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  31.7 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  28.7 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  32.26 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  29.51 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.49 
 
 
292 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  27.91 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  25.33 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.14 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  32.49 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  32.16 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  28.63 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>