128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3760 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  36.76 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  37.26 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  32.68 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  35.51 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  40 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  33.99 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  33.73 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  30.36 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  35.23 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  38.34 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  33.59 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  32.52 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  32.44 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  32.82 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  30.17 
 
 		 316 aa  85.1  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  30.64 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  35.33 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  31.43 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  32.28 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  34.83 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  32.35 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  37.07 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  25.1 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  30.66 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  32.13 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  36.22 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  31.82 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  34.36 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  31.1 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  37.17 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  34.27 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  31.67 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  25.94 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  27.57 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  31.3 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  30.4 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  30.83 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  32.14 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  31.84 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  34.45 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  35.63 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  27.03 
 
 		 298 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  34.34 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  37.08 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  28.51 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.65 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.18 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  30.49 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  27.07 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  29.04 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.08 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.02 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.02 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  25.38 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  34.22 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.02 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.02 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  30.16 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  31.79 
 
 		 636 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  30.64 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.5 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.5 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.5 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  32.49 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.85 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  27.92 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  28.78 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  28.94 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  25.2 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  30.23 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  30.93 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  31.89 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  32.85 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  32.78 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  36.26 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  26.34 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  33.53 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  29.25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  31.71 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  30.57 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  28.05 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.11 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  28.65 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  33.7 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>